1.) Die Verfärbungen. Ist das ein Pilz oder sind das Reste von der Rinde o. ä.? Ich hoffe mal letzteres. Eigentlich wurden die Latten im Dampf ja quasi sterilisiert:).
2.)Die Abdrücke der Schraubzwingen. Die solltest du vor der Verzahnung noch wegnehmen, da du dir sonst wahrscheinlich Blasen in der Leimfuge einfängst. Am besten von vornherein Vermeiden durch Verwendung des flachen Endes der Schraubzwinge oder durch Unterlegen eines breiten Holzstückes vor dem Festziehen. Habe das gleiche Problem aber auch schon gehabt

3.)Eine der Stellen die du markiert hast sieht aus wie ein kleiner Riss in der Oberfläche!? Einfach rausschleifen, wenn de so ist.
Ansonsten Geduld und einfach trocknen lassen

Viele Grüße
Kevin